2013年12月26日上午上海市第十四屆人大常委會第十次會議就市政府關于2013年環境保護工作情況展開專題詢問。針對常委會委員吳堯鑫關于上海水質改善有沒有明確的預期目標，以及會采取哪些有針對性的防治措施，使河道的生態得到進一步的改善的提問。市水務局表示，將繼續對全市7000多處直接污染源進行整治，并在“十二五”末，通過綜合整治使全市水環境功能區達標比例達到53%。

市水務局坦言，目前上海的水環境主要表現在三個方面。第一，部分河道臟亂差的面貌沒有得到根本的改觀，特別是城郊結合部臟亂差問題比較嚴重，直排污水的情況還存在，有些河道成為垃圾的堆場。第二，部分污染源直排河道現象還存在。經對全市直排污染源的地毯式的排摸，全市有7724個直排污染源的污水直排入河道，這也是造成河道污染主要的原因之一。第三，現在水環境的質量以及水功能區的規劃與目標之間存在比較大的差距。

針對這一情況上海水務局表示，2014年將結合太湖流域，在管理機構協調下加大太湖下行流量，目前太湖在有關機構的協調下主要通過從長江引清水進太湖，從太湖放清水到浙江和上海，使河道水環境引入清水。同時，結合運行調動的功能，加大上海區域內部的引進調水工作，進一步改善水環境。
與此同時，接下來將要繼續加強集污納管的整治工作。針對全市有7000多處的直排污染源，水務局已出臺整治措施，并對于集污納管的工作給予補貼獎勵，由各個區縣進行，市政府對相關工作給予獎勵補貼。同時，加大對直排污水管理的執法力度，用倒逼機制使直排污染源納入污水管道中。

 水務局表示，在“十二五”末，通過綜合整治使全市水環境功能區達標比例達到53%，這也是國家實行最嚴格水資源管理當中的一項工作目標。按照該工作目標，“十二五”期末，剔除上游來水標準的影響，中心城區骨干河道的水質基本上可以實現五類水的標準。黃浦江上游的骨干河道水質達到四類，崇明島的骨干河道水質標準要達到三類水標準，其余水質標準要達到穩中有升的目標。